El Palacio de Congresos se encuentra ubicado en la zona monumental de Córdoba, concentrada en el sector sur-occidental de la ciudad, cercano al río Guadalquivir y en el casco histórico, declarado Patrimonio de la Humanidad, a escasos metros de la Mezquita-Catedral de Córdoba.
El edificio que alberga el actual Palacio de Congresos se construyó entre 1513 y 1516, por encargo del Cabildo Catedralicio de Córdoba al maestro Hernán Ruiz I, como Hospital de San Sebastián, el mayor de la ciudad hasta 1724 El núcleo principal del edificio histórico se articula en torno a un patio porticado con galerías de factura mudéjar, con arcos peraltados en planta baja y rebajados en planta alta. En uno de los lados del patio se observa aún la muralla del antiguo Alcázar Califal del siglo X. El Palacio incorpora en su fachada una capilla con acceso propio desde la calle, a través de una de las mejores portadas del gótico humanista cordobés.